Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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PtprqP0C5E4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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PtprqP0C5E4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprqP0C5E4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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