Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf1P09925 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Surf1P09925 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf1P09925 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf1P09925 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf1P09925 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf1P09925 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms