Protein–RNA interactions for Protein: P09174

Pde6g, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6gP09174 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Pde6gP09174 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Pde6gP09174 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pde6gP09174 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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