Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxa5P09021 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxa5P09021 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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