Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ApoeP08226 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApoeP08226 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApoeP08226 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApoeP08226 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApoeP08226 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms