Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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