Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Spta1P08032 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Spta1P08032 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spta1P08032 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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