Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TnfP06804 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TnfP06804 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TnfP06804 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TnfP06804 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TnfP06804 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TnfP06804 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TnfP06804 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TnfP06804 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TnfP06804 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TnfP06804 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TnfP06804 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TnfP06804 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TnfP06804 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TnfP06804 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnfP06804 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnfP06804 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnfP06804 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnfP06804 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnfP06804 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnfP06804 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnfP06804 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnfP06804 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnfP06804 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnfP06804 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TnfP06804 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnfP06804 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnfP06804 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TnfP06804 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnfP06804 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnfP06804 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnfP06804 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnfP06804 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnfP06804 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnfP06804 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnfP06804 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnfP06804 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnfP06804 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TnfP06804 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TnfP06804 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TnfP06804 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TnfP06804 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms