Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms