Protein–RNA interactions for Protein: P06332

Cd4, T-cell surface glycoprotein CD4, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd4P06332 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd4P06332 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd4P06332 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd4P06332 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms