Protein–RNA interactions for Protein: P05784

Krt18, Keratin, type I cytoskeletal 18, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt18P05784 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt18P05784 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt18P05784 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt18P05784 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt18P05784 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt18P05784 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt18P05784 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms