Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P04212 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P04212 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04212 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04212 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04212 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04212 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04212 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04212 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04212 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04212 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04212 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P04212 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04212 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04212 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04212 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04212 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04212 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04212 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04212 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04212 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04212 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04212 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04212 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms