Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt1P04104 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt1P04104 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt1P04104 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt1P04104 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt1P04104 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt1P04104 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt1P04104 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt1P04104 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt1P04104 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt1P04104 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt1P04104 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt1P04104 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt1P04104 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt1P04104 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt1P04104 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt1P04104 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt1P04104 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt1P04104 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt1P04104 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt1P04104 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt1P04104 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt1P04104 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt1P04104 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt1P04104 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms