Protein–RNA interactions for Protein: P01808

Ig heavy chain V region T601, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01808 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01808 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01808 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01808 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01808 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01808 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01808 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01808 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01808 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01808 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01808 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01808 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01808 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01808 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01808 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01808 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01808 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01808 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01808 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01808 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01808 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01808 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01808 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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P01808 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01808 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01808 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01808 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01808 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01808 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01808 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01808 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01808 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01808 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01808 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01808 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01808 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01808 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01808 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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P01808 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01808 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01808 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01808 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01808 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01808 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01808 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01808 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01808 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01808 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01808 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01808 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01808 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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