Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01641 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01641 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01641 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01641 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01641 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01641 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01641 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01641 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01641 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01641 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01641 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01641 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01641 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01641 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01641 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01641 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01641 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01641 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01641 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01641 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01641 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01641 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01641 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01641 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01641 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01641 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01641 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01641 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01641 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01641 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01641 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01641 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01641 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01641 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01641 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01641 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01641 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01641 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01641 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01641 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01641 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01641 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01641 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01641 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01641 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01641 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01641 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01641 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01641 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01641 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01641 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01641 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01641 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01641 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01641 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01641 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01641 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01641 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01641 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01641 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01641 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01641 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01641 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01641 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01641 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01641 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01641 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01641 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01641 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01641 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01641 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01641 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01641 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01641 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01641 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01641 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01641 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01641 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01641 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01641 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01641 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01641 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01641 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01641 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01641 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01641 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01641 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01641 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01641 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01641 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01641 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01641 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01641 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01641 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01641 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01641 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01641 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01641 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01641 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms