Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gnpda1O88958 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms