Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BlmO88700 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BlmO88700 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BlmO88700 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BlmO88700 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BlmO88700 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BlmO88700 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BlmO88700 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BlmO88700 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BlmO88700 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BlmO88700 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BlmO88700 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BlmO88700 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BlmO88700 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BlmO88700 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BlmO88700 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BlmO88700 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BlmO88700 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BlmO88700 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BlmO88700 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BlmO88700 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BlmO88700 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BlmO88700 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BlmO88700 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BlmO88700 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BlmO88700 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BlmO88700 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BlmO88700 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BlmO88700 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BlmO88700 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BlmO88700 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BlmO88700 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BlmO88700 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BlmO88700 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BlmO88700 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BlmO88700 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BlmO88700 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BlmO88700 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BlmO88700 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BlmO88700 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BlmO88700 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BlmO88700 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BlmO88700 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BlmO88700 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BlmO88700 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BlmO88700 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BlmO88700 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BlmO88700 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BlmO88700 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BlmO88700 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BlmO88700 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BlmO88700 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BlmO88700 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BlmO88700 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BlmO88700 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BlmO88700 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BlmO88700 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BlmO88700 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BlmO88700 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BlmO88700 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BlmO88700 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BlmO88700 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BlmO88700 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BlmO88700 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BlmO88700 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BlmO88700 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BlmO88700 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BlmO88700 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BlmO88700 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BlmO88700 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BlmO88700 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BlmO88700 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BlmO88700 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BlmO88700 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BlmO88700 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BlmO88700 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BlmO88700 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BlmO88700 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BlmO88700 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BlmO88700 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms