Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dll3O88516 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dll3O88516 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dll3O88516 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dll3O88516 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dll3O88516 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dll3O88516 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms