Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3aO88508 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms