Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AvilO88398 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AvilO88398 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AvilO88398 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AvilO88398 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AvilO88398 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AvilO88398 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AvilO88398 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AvilO88398 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AvilO88398 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AvilO88398 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AvilO88398 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AvilO88398 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AvilO88398 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AvilO88398 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AvilO88398 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AvilO88398 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AvilO88398 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AvilO88398 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AvilO88398 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AvilO88398 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AvilO88398 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AvilO88398 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AvilO88398 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms