Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms