Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Col5a1O88207 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Col5a1O88207 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Col5a1O88207 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Col5a1O88207 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Col5a1O88207 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a1O88207 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a1O88207 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a1O88207 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a1O88207 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a1O88207 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a1O88207 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a1O88207 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a1O88207 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a1O88207 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a1O88207 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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