Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CaskO70589 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CaskO70589 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CaskO70589 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CaskO70589 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CaskO70589 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CaskO70589 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CaskO70589 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CaskO70589 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CaskO70589 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CaskO70589 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CaskO70589 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CaskO70589 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CaskO70589 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CaskO70589 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CaskO70589 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CaskO70589 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CaskO70589 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CaskO70589 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CaskO70589 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CaskO70589 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CaskO70589 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CaskO70589 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CaskO70589 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CaskO70589 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CaskO70589 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CaskO70589 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CaskO70589 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CaskO70589 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CaskO70589 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CaskO70589 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CaskO70589 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CaskO70589 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CaskO70589 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CaskO70589 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CaskO70589 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CaskO70589 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CaskO70589 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CaskO70589 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CaskO70589 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CaskO70589 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CaskO70589 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CaskO70589 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CaskO70589 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CaskO70589 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CaskO70589 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CaskO70589 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CaskO70589 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CaskO70589 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CaskO70589 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CaskO70589 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CaskO70589 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CaskO70589 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CaskO70589 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CaskO70589 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CaskO70589 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CaskO70589 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CaskO70589 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CaskO70589 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CaskO70589 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CaskO70589 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CaskO70589 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CaskO70589 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CaskO70589 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CaskO70589 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CaskO70589 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CaskO70589 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CaskO70589 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CaskO70589 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CaskO70589 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CaskO70589 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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