Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Xirp1O70373 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms