Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrna4O70174 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms