Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad51dO55230 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rad51dO55230 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad51dO55230 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad51dO55230 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rad51dO55230 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad51dO55230 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad51dO55230 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad51dO55230 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad51dO55230 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad51dO55230 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad51dO55230 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad51dO55230 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad51dO55230 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rad51dO55230 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad51dO55230 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rad51dO55230 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad51dO55230 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad51dO55230 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad51dO55230 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad51dO55230 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad51dO55230 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad51dO55230 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad51dO55230 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad51dO55230 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rad51dO55230 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad51dO55230 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad51dO55230 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad51dO55230 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad51dO55230 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad51dO55230 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad51dO55230 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad51dO55230 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad51dO55230 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad51dO55230 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad51dO55230 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad51dO55230 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad51dO55230 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad51dO55230 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad51dO55230 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rad51dO55230 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad51dO55230 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad51dO55230 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad51dO55230 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad51dO55230 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad51dO55230 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad51dO55230 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51dO55230 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51dO55230 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51dO55230 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51dO55230 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51dO55230 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51dO55230 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51dO55230 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rad51dO55230 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51dO55230 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51dO55230 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51dO55230 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51dO55230 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51dO55230 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51dO55230 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51dO55230 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51dO55230 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51dO55230 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51dO55230 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51dO55230 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51dO55230 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51dO55230 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51dO55230 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51dO55230 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad51dO55230 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad51dO55230 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rad51dO55230 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad51dO55230 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad51dO55230 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad51dO55230 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad51dO55230 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad51dO55230 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad51dO55230 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad51dO55230 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rad51dO55230 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad51dO55230 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad51dO55230 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad51dO55230 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad51dO55230 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad51dO55230 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad51dO55230 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad51dO55230 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad51dO55230 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51dO55230 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51dO55230 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51dO55230 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51dO55230 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51dO55230 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51dO55230 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51dO55230 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51dO55230 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51dO55230 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51dO55230 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad51dO55230 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms