Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtogO55225 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtogO55225 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtogO55225 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtogO55225 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtogO55225 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtogO55225 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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OtogO55225 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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OtogO55225 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtogO55225 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
OtogO55225 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms