Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt5hO55201 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms