Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap2O55126 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms