Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms