Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn20O55082 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms