Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SlkO54988 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SlkO54988 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SlkO54988 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SlkO54988 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SlkO54988 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SlkO54988 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SlkO54988 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SlkO54988 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SlkO54988 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SlkO54988 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SlkO54988 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SlkO54988 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SlkO54988 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SlkO54988 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SlkO54988 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SlkO54988 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SlkO54988 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SlkO54988 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SlkO54988 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SlkO54988 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SlkO54988 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SlkO54988 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SlkO54988 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SlkO54988 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SlkO54988 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SlkO54988 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SlkO54988 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SlkO54988 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SlkO54988 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SlkO54988 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SlkO54988 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SlkO54988 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SlkO54988 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SlkO54988 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SlkO54988 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SlkO54988 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SlkO54988 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SlkO54988 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SlkO54988 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SlkO54988 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SlkO54988 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SlkO54988 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SlkO54988 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SlkO54988 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SlkO54988 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SlkO54988 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SlkO54988 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SlkO54988 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SlkO54988 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SlkO54988 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SlkO54988 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SlkO54988 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SlkO54988 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SlkO54988 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SlkO54988 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SlkO54988 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SlkO54988 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SlkO54988 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SlkO54988 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SlkO54988 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SlkO54988 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SlkO54988 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SlkO54988 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SlkO54988 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SlkO54988 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms