Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

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Length 527 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NlkO54949 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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NlkO54949 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NlkO54949 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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NlkO54949 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NlkO54949 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NlkO54949 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NlkO54949 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NlkO54949 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NlkO54949 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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NlkO54949 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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NlkO54949 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NlkO54949 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NlkO54949 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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NlkO54949 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NlkO54949 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NlkO54949 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NlkO54949 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NlkO54949 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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NlkO54949 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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NlkO54949 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NlkO54949 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NlkO54949 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NlkO54949 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NlkO54949 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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NlkO54949 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NlkO54949 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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NlkO54949 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NlkO54949 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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NlkO54949 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NlkO54949 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NlkO54949 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NlkO54949 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NlkO54949 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NlkO54949 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NlkO54949 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NlkO54949 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NlkO54949 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NlkO54949 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NlkO54949 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NlkO54949 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NlkO54949 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NlkO54949 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NlkO54949 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NlkO54949 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NlkO54949 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms