Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2f6O54917 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2f6O54917 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2f6O54917 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2f6O54917 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2f6O54917 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f6O54917 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms