Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp10aO54827 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp10aO54827 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp10aO54827 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp10aO54827 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp10aO54827 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp10aO54827 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp10aO54827 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp10aO54827 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp10aO54827 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp10aO54827 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp10aO54827 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp10aO54827 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms