Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffbO54788 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffbO54788 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffbO54788 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffbO54788 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffbO54788 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffbO54788 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffbO54788 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffbO54788 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffbO54788 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffbO54788 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffbO54788 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffbO54788 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffbO54788 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffbO54788 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DffbO54788 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DffbO54788 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffbO54788 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffbO54788 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffbO54788 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffbO54788 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffbO54788 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffbO54788 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffbO54788 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffbO54788 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffbO54788 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffbO54788 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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DffbO54788 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DffbO54788 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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