Protein–RNA interactions for Protein: O35949

Elovl3, Elongation of very long chain fatty acids protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elovl3O35949 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elovl3O35949 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms