Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FxnO35943 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FxnO35943 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FxnO35943 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FxnO35943 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FxnO35943 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FxnO35943 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FxnO35943 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FxnO35943 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FxnO35943 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FxnO35943 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FxnO35943 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FxnO35943 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FxnO35943 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FxnO35943 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FxnO35943 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FxnO35943 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FxnO35943 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FxnO35943 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FxnO35943 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FxnO35943 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FxnO35943 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FxnO35943 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FxnO35943 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FxnO35943 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FxnO35943 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FxnO35943 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FxnO35943 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FxnO35943 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FxnO35943 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FxnO35943 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
FxnO35943 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FxnO35943 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FxnO35943 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FxnO35943 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FxnO35943 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FxnO35943 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FxnO35943 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FxnO35943 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FxnO35943 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FxnO35943 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
FxnO35943 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FxnO35943 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FxnO35943 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FxnO35943 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FxnO35943 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FxnO35943 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FxnO35943 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FxnO35943 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FxnO35943 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FxnO35943 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FxnO35943 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FxnO35943 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FxnO35943 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FxnO35943 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FxnO35943 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FxnO35943 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FxnO35943 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FxnO35943 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FxnO35943 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FxnO35943 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FxnO35943 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FxnO35943 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FxnO35943 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FxnO35943 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FxnO35943 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
FxnO35943 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FxnO35943 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FxnO35943 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms