Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms