Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cited2O35740 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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