Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf18O35714 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms