Protein–RNA interactions for Protein: O35609

Scamp3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp3O35609 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp3O35609 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp3O35609 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp3O35609 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp3O35609 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp3O35609 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp3O35609 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp3O35609 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp3O35609 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp3O35609 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp3O35609 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp3O35609 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp3O35609 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scamp3O35609 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scamp3O35609 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scamp3O35609 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scamp3O35609 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scamp3O35609 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scamp3O35609 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scamp3O35609 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp3O35609 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms