Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RaxO35602 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RaxO35602 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RaxO35602 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RaxO35602 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RaxO35602 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RaxO35602 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RaxO35602 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RaxO35602 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RaxO35602 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RaxO35602 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RaxO35602 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RaxO35602 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RaxO35602 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RaxO35602 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RaxO35602 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RaxO35602 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RaxO35602 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RaxO35602 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RaxO35602 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RaxO35602 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RaxO35602 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RaxO35602 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RaxO35602 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RaxO35602 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RaxO35602 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RaxO35602 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RaxO35602 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RaxO35602 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RaxO35602 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RaxO35602 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RaxO35602 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RaxO35602 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RaxO35602 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RaxO35602 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RaxO35602 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RaxO35602 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RaxO35602 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RaxO35602 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RaxO35602 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RaxO35602 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RaxO35602 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RaxO35602 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RaxO35602 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RaxO35602 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RaxO35602 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RaxO35602 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RaxO35602 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms