Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a6O35544 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms