Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx1aO35526 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms