Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema6aO35464 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms