Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TnxbO35452 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TnxbO35452 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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TnxbO35452 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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TnxbO35452 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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TnxbO35452 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TnxbO35452 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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TnxbO35452 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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TnxbO35452 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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TnxbO35452 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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TnxbO35452 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TnxbO35452 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TnxbO35452 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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