Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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