Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rnf5O35445 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rnf5O35445 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnf5O35445 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnf5O35445 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnf5O35445 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnf5O35445 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnf5O35445 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnf5O35445 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rnf5O35445 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rnf5O35445 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rnf5O35445 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rnf5O35445 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf5O35445 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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