Protein–RNA interactions for Protein: O35405

Pld3, Phospholipase D3, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld3O35405 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld3O35405 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld3O35405 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pld3O35405 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pld3O35405 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pld3O35405 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pld3O35405 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pld3O35405 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pld3O35405 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pld3O35405 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pld3O35405 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pld3O35405 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pld3O35405 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pld3O35405 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pld3O35405 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pld3O35405 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pld3O35405 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pld3O35405 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pld3O35405 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pld3O35405 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pld3O35405 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms